Le monophysisme divise l'église de Byzance car ce courant de pensée remet radicalement en cause la doctrine chrétienne définie par le concile de Chalcédoine en 451. Le monophysisme ne reconnaît que la seule nature, divine de Jésus-Christ, contrairement au courant traditionnel orthodoxe qui la croit à la fois divine et humaine.
Ces luttes fratricides ponctuées par le schisme d'Alsace de 484 avec l'église romaine feront finement le jeu des Arabes, nouvellement convertis à l'Islam, et qui ont lancé la conquête de l'Orient.