Cette forme hexagonale des flocons de neige est due à l'arrangement de ses composants élémentaires : les atomes de l'eau.

Les atomes ne sont pas alignés dans la molécule d'eau : à cause de l'arrangement electronique des liaisons, elle a une structure coudée, l'angle H-O-H faisant environ 104.5
Donc, lorsque le cristal se forme (quand l'eau se fige en glace), les molécules se positionnent en suivant les liaisons hydrogènes entre elles. Et la forme coudée de la molécule fait que l'on aboutit à une structure en 3D, complexe, mais toujours hexagonale.