Pourquoi l'eau est-elle transparente ?

Comme pour le verre, parce que l'indice de réflexion de la surface est faible, les rayons lumineux y pénètrent, se reflètent sur les objets dans l'eau et nous reviennent.

En fait l'eau n'est pas parfaitement transparente (seul le vide l'est) mais hautement translucide.
Une petite partie des rayons n'y pénètre pas, de là les réflexions sur la surface.