''Pis'' est l'ancienne forme pour ''pire'', donc l'expression faire ''pis que pendre'' à quelqu'un, c'est ''lui en faire voir de toutes les couleurs'' (un autre bon pourquoi !) : soit lui faire subir pire que la pendaison, soit des tourments sévèrement punis (la pendaison a longtemps été, et un peu partout dans le monde, une forme courante de châtiment pour les malfrats).

Evidemment, de nos jours, quand on dit ça par exemple d'un enfant pour ses parents, on exagère un peu...